Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
ECM29Q5VYK3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms