Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
EFCAB2Q5VUJ9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
EFCAB2Q5VUJ9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms