Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms