Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MS4A13Q5J8X5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MS4A13Q5J8X5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MS4A13Q5J8X5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MS4A13Q5J8X5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A13Q5J8X5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms