Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms