Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms