Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTC1Q2NKJ3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms