Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP3Q15836 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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