Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
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