Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD6Q15008 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD6Q15008 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD6Q15008 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD6Q15008 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD6Q15008 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD6Q15008 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD6Q15008 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD6Q15008 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD6Q15008 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD6Q15008 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD6Q15008 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD6Q15008 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD6Q15008 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD6Q15008 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD6Q15008 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD6Q15008 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD6Q15008 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD6Q15008 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD6Q15008 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD6Q15008 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD6Q15008 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD6Q15008 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD6Q15008 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD6Q15008 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD6Q15008 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD6Q15008 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD6Q15008 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD6Q15008 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD6Q15008 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD6Q15008 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD6Q15008 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD6Q15008 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD6Q15008 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
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