Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB39AQ14964 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB39AQ14964 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RAB39AQ14964 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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RAB39AQ14964 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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RAB39AQ14964 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB39AQ14964 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
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