Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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IRF3Q14653 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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IRF3Q14653 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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