Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN5AQ14524 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
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