Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDX39BQ13838 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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