Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NAE1Q13564 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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NAE1Q13564 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NAE1Q13564 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms