Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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