Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MSLNQ13421 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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