Protein–RNA interactions for Protein: Q13330

MTA1, Metastasis-associated protein MTA1, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1Q13330 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MTA1Q13330 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTA1Q13330 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTA1Q13330 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTA1Q13330 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTA1Q13330 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTA1Q13330 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTA1Q13330 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTA1Q13330 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTA1Q13330 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTA1Q13330 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTA1Q13330 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTA1Q13330 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTA1Q13330 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTA1Q13330 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTA1Q13330 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTA1Q13330 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTA1Q13330 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTA1Q13330 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MTA1Q13330 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MTA1Q13330 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTA1Q13330 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MTA1Q13330 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTA1Q13330 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTA1Q13330 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTA1Q13330 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTA1Q13330 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTA1Q13330 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTA1Q13330 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MTA1Q13330 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MTA1Q13330 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MTA1Q13330 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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