Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPA4Q13156 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
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