Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RESTQ13127 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RESTQ13127 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RESTQ13127 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RESTQ13127 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RESTQ13127 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RESTQ13127 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RESTQ13127 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RESTQ13127 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RESTQ13127 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RESTQ13127 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RESTQ13127 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RESTQ13127 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RESTQ13127 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RESTQ13127 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RESTQ13127 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RESTQ13127 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RESTQ13127 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RESTQ13127 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RESTQ13127 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RESTQ13127 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RESTQ13127 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RESTQ13127 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RESTQ13127 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RESTQ13127 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RESTQ13127 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RESTQ13127 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RESTQ13127 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RESTQ13127 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RESTQ13127 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RESTQ13127 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RESTQ13127 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RESTQ13127 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RESTQ13127 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RESTQ13127 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RESTQ13127 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RESTQ13127 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RESTQ13127 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RESTQ13127 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RESTQ13127 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RESTQ13127 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RESTQ13127 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RESTQ13127 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RESTQ13127 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RESTQ13127 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RESTQ13127 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RESTQ13127 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RESTQ13127 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RESTQ13127 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RESTQ13127 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RESTQ13127 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RESTQ13127 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RESTQ13127 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RESTQ13127 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RESTQ13127 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RESTQ13127 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RESTQ13127 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RESTQ13127 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RESTQ13127 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RESTQ13127 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RESTQ13127 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RESTQ13127 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RESTQ13127 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RESTQ13127 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RESTQ13127 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RESTQ13127 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RESTQ13127 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RESTQ13127 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RESTQ13127 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RESTQ13127 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RESTQ13127 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RESTQ13127 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RESTQ13127 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RESTQ13127 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RESTQ13127 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RESTQ13127 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RESTQ13127 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RESTQ13127 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RESTQ13127 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RESTQ13127 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RESTQ13127 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RESTQ13127 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RESTQ13127 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RESTQ13127 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RESTQ13127 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RESTQ13127 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RESTQ13127 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RESTQ13127 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RESTQ13127 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RESTQ13127 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RESTQ13127 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RESTQ13127 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RESTQ13127 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RESTQ13127 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RESTQ13127 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RESTQ13127 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RESTQ13127 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RESTQ13127 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RESTQ13127 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RESTQ13127 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
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