Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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CHAF1BQ13112 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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CHAF1BQ13112 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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CHAF1BQ13112 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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