Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NPRL3Q12980 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NPRL3Q12980 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPRL3Q12980 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPRL3Q12980 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPRL3Q12980 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPRL3Q12980 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPRL3Q12980 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPRL3Q12980 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms