Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LMAN2Q12907 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms