Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP4Q09028 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms