Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms