Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TFF3Q07654 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms