Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR3Q06889 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms