Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF85Q03923 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF85Q03923 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms