Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms