Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAE1P78406 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAE1P78406 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAE1P78406 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAE1P78406 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAE1P78406 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAE1P78406 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAE1P78406 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAE1P78406 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAE1P78406 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAE1P78406 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAE1P78406 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAE1P78406 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAE1P78406 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAE1P78406 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAE1P78406 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAE1P78406 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAE1P78406 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAE1P78406 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAE1P78406 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAE1P78406 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAE1P78406 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAE1P78406 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAE1P78406 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAE1P78406 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAE1P78406 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAE1P78406 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAE1P78406 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAE1P78406 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAE1P78406 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAE1P78406 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAE1P78406 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAE1P78406 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAE1P78406 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAE1P78406 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAE1P78406 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAE1P78406 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAE1P78406 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAE1P78406 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAE1P78406 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAE1P78406 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RAE1P78406 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAE1P78406 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAE1P78406 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAE1P78406 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAE1P78406 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAE1P78406 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAE1P78406 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAE1P78406 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAE1P78406 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAE1P78406 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAE1P78406 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAE1P78406 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAE1P78406 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAE1P78406 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAE1P78406 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAE1P78406 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAE1P78406 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAE1P78406 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAE1P78406 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAE1P78406 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAE1P78406 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAE1P78406 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAE1P78406 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAE1P78406 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAE1P78406 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAE1P78406 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAE1P78406 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAE1P78406 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAE1P78406 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAE1P78406 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAE1P78406 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAE1P78406 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAE1P78406 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAE1P78406 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAE1P78406 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAE1P78406 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAE1P78406 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAE1P78406 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAE1P78406 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAE1P78406 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAE1P78406 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAE1P78406 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAE1P78406 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAE1P78406 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAE1P78406 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAE1P78406 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAE1P78406 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAE1P78406 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAE1P78406 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAE1P78406 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAE1P78406 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAE1P78406 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAE1P78406 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAE1P78406 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAE1P78406 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAE1P78406 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAE1P78406 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAE1P78406 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAE1P78406 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms