Protein–RNA interactions for Protein: P78386

KRT85, Keratin, type II cuticular Hb5, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT85P78386 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT85P78386 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT85P78386 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT85P78386 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT85P78386 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT85P78386 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT85P78386 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT85P78386 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT85P78386 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT85P78386 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT85P78386 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT85P78386 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT85P78386 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT85P78386 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT85P78386 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT85P78386 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT85P78386 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT85P78386 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT85P78386 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT85P78386 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT85P78386 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT85P78386 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT85P78386 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT85P78386 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT85P78386 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT85P78386 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT85P78386 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT85P78386 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT85P78386 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT85P78386 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT85P78386 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT85P78386 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT85P78386 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT85P78386 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT85P78386 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT85P78386 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT85P78386 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT85P78386 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT85P78386 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT85P78386 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT85P78386 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT85P78386 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT85P78386 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT85P78386 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT85P78386 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT85P78386 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT85P78386 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT85P78386 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT85P78386 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT85P78386 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT85P78386 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT85P78386 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT85P78386 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT85P78386 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT85P78386 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT85P78386 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT85P78386 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT85P78386 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT85P78386 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT85P78386 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT85P78386 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT85P78386 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT85P78386 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT85P78386 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT85P78386 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT85P78386 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT85P78386 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT85P78386 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT85P78386 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT85P78386 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT85P78386 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT85P78386 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT85P78386 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT85P78386 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT85P78386 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT85P78386 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT85P78386 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT85P78386 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT85P78386 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT85P78386 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT85P78386 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT85P78386 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT85P78386 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT85P78386 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT85P78386 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT85P78386 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT85P78386 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT85P78386 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT85P78386 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT85P78386 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT85P78386 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT85P78386 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT85P78386 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT85P78386 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT85P78386 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT85P78386 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT85P78386 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT85P78386 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT85P78386 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT85P78386 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms