Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACTA1P68133 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms