Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms