Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms