Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB25P57735 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAB25P57735 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAB25P57735 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB25P57735 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB25P57735 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB25P57735 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB25P57735 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB25P57735 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB25P57735 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB25P57735 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB25P57735 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB25P57735 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB25P57735 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB25P57735 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB25P57735 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB25P57735 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB25P57735 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB25P57735 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB25P57735 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB25P57735 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB25P57735 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB25P57735 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB25P57735 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB25P57735 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB25P57735 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB25P57735 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB25P57735 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB25P57735 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB25P57735 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB25P57735 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB25P57735 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB25P57735 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB25P57735 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB25P57735 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB25P57735 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB25P57735 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB25P57735 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB25P57735 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB25P57735 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB25P57735 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB25P57735 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB25P57735 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB25P57735 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB25P57735 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB25P57735 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB25P57735 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB25P57735 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB25P57735 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB25P57735 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB25P57735 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB25P57735 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB25P57735 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB25P57735 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB25P57735 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB25P57735 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB25P57735 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB25P57735 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB25P57735 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB25P57735 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB25P57735 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB25P57735 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB25P57735 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB25P57735 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB25P57735 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB25P57735 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB25P57735 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB25P57735 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB25P57735 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB25P57735 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB25P57735 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB25P57735 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB25P57735 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB25P57735 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB25P57735 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB25P57735 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB25P57735 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB25P57735 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB25P57735 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB25P57735 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB25P57735 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB25P57735 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB25P57735 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB25P57735 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB25P57735 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB25P57735 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB25P57735 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB25P57735 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB25P57735 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB25P57735 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB25P57735 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB25P57735 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB25P57735 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB25P57735 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB25P57735 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB25P57735 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB25P57735 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB25P57735 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB25P57735 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB25P57735 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms