Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF3P57682 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF3P57682 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF3P57682 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF3P57682 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF3P57682 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF3P57682 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF3P57682 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF3P57682 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF3P57682 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF3P57682 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF3P57682 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF3P57682 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF3P57682 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF3P57682 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF3P57682 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF3P57682 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF3P57682 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF3P57682 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF3P57682 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF3P57682 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF3P57682 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF3P57682 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF3P57682 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF3P57682 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF3P57682 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF3P57682 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF3P57682 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF3P57682 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF3P57682 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF3P57682 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF3P57682 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF3P57682 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF3P57682 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF3P57682 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF3P57682 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF3P57682 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF3P57682 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF3P57682 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF3P57682 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF3P57682 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF3P57682 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF3P57682 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF3P57682 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF3P57682 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF3P57682 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF3P57682 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF3P57682 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF3P57682 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF3P57682 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF3P57682 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF3P57682 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF3P57682 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF3P57682 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF3P57682 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF3P57682 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF3P57682 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF3P57682 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF3P57682 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF3P57682 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF3P57682 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF3P57682 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF3P57682 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF3P57682 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF3P57682 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF3P57682 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF3P57682 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF3P57682 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF3P57682 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF3P57682 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF3P57682 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF3P57682 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF3P57682 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF3P57682 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF3P57682 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF3P57682 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF3P57682 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF3P57682 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF3P57682 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF3P57682 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF3P57682 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF3P57682 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF3P57682 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF3P57682 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF3P57682 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF3P57682 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF3P57682 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF3P57682 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF3P57682 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF3P57682 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF3P57682 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF3P57682 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF3P57682 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF3P57682 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF3P57682 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF3P57682 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF3P57682 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF3P57682 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF3P57682 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF3P57682 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms