Protein–RNA interactions for Protein: P57087

JAM2, Junctional adhesion molecule B, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAM2P57087 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
JAM2P57087 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
JAM2P57087 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
JAM2P57087 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
JAM2P57087 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
JAM2P57087 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
JAM2P57087 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
JAM2P57087 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
JAM2P57087 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
JAM2P57087 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
JAM2P57087 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
JAM2P57087 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
JAM2P57087 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
JAM2P57087 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
JAM2P57087 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
JAM2P57087 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
JAM2P57087 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
JAM2P57087 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
JAM2P57087 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
JAM2P57087 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
JAM2P57087 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
JAM2P57087 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
JAM2P57087 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
JAM2P57087 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
JAM2P57087 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
JAM2P57087 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
JAM2P57087 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
JAM2P57087 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
JAM2P57087 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
JAM2P57087 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
JAM2P57087 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
JAM2P57087 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
JAM2P57087 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
JAM2P57087 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
JAM2P57087 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
JAM2P57087 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
JAM2P57087 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
JAM2P57087 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
JAM2P57087 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
JAM2P57087 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
JAM2P57087 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
JAM2P57087 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
JAM2P57087 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
JAM2P57087 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
JAM2P57087 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
JAM2P57087 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
JAM2P57087 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
JAM2P57087 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
JAM2P57087 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
JAM2P57087 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
JAM2P57087 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
JAM2P57087 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
JAM2P57087 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
JAM2P57087 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
JAM2P57087 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
JAM2P57087 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
JAM2P57087 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
JAM2P57087 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
JAM2P57087 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
JAM2P57087 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
JAM2P57087 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
JAM2P57087 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
JAM2P57087 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
JAM2P57087 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
JAM2P57087 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
JAM2P57087 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
JAM2P57087 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
JAM2P57087 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
JAM2P57087 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
JAM2P57087 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
JAM2P57087 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
JAM2P57087 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
JAM2P57087 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
JAM2P57087 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
JAM2P57087 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
JAM2P57087 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
JAM2P57087 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
JAM2P57087 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
JAM2P57087 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
JAM2P57087 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
JAM2P57087 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
JAM2P57087 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
JAM2P57087 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
JAM2P57087 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
JAM2P57087 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
JAM2P57087 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
JAM2P57087 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
JAM2P57087 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
JAM2P57087 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
JAM2P57087 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
JAM2P57087 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
JAM2P57087 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
JAM2P57087 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
JAM2P57087 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
JAM2P57087 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
JAM2P57087 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
JAM2P57087 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
JAM2P57087 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
JAM2P57087 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
JAM2P57087 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms