Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX10P56693 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX10P56693 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX10P56693 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX10P56693 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX10P56693 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX10P56693 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX10P56693 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX10P56693 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX10P56693 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX10P56693 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX10P56693 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX10P56693 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX10P56693 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX10P56693 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX10P56693 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX10P56693 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX10P56693 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX10P56693 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX10P56693 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX10P56693 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX10P56693 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX10P56693 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX10P56693 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX10P56693 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX10P56693 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX10P56693 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX10P56693 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX10P56693 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX10P56693 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX10P56693 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX10P56693 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX10P56693 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX10P56693 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOX10P56693 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOX10P56693 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOX10P56693 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOX10P56693 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOX10P56693 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SOX10P56693 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOX10P56693 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOX10P56693 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOX10P56693 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOX10P56693 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX10P56693 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX10P56693 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX10P56693 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX10P56693 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX10P56693 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX10P56693 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX10P56693 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX10P56693 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX10P56693 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX10P56693 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX10P56693 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX10P56693 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX10P56693 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX10P56693 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX10P56693 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX10P56693 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX10P56693 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX10P56693 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX10P56693 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX10P56693 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX10P56693 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX10P56693 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX10P56693 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX10P56693 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX10P56693 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX10P56693 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX10P56693 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX10P56693 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX10P56693 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX10P56693 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX10P56693 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX10P56693 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX10P56693 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX10P56693 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX10P56693 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX10P56693 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX10P56693 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX10P56693 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX10P56693 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX10P56693 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX10P56693 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX10P56693 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX10P56693 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SOX10P56693 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SOX10P56693 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX10P56693 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX10P56693 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX10P56693 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX10P56693 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX10P56693 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX10P56693 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX10P56693 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX10P56693 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX10P56693 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX10P56693 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX10P56693 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms