Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRP1P56182 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRP1P56182 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRP1P56182 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRP1P56182 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRP1P56182 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRP1P56182 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRP1P56182 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRP1P56182 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRP1P56182 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRP1P56182 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRP1P56182 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRP1P56182 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRP1P56182 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRP1P56182 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRP1P56182 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRP1P56182 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRP1P56182 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRP1P56182 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRP1P56182 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRP1P56182 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRP1P56182 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RRP1P56182 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRP1P56182 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP1P56182 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP1P56182 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP1P56182 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP1P56182 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP1P56182 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP1P56182 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP1P56182 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP1P56182 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP1P56182 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP1P56182 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP1P56182 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP1P56182 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP1P56182 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP1P56182 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP1P56182 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP1P56182 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRP1P56182 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRP1P56182 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRP1P56182 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRP1P56182 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRP1P56182 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRP1P56182 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRP1P56182 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRP1P56182 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRP1P56182 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RRP1P56182 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRP1P56182 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRP1P56182 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRP1P56182 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRP1P56182 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RRP1P56182 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRP1P56182 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRP1P56182 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RRP1P56182 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRP1P56182 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRP1P56182 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRP1P56182 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRP1P56182 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRP1P56182 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRP1P56182 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP1P56182 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP1P56182 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP1P56182 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP1P56182 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP1P56182 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP1P56182 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP1P56182 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP1P56182 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP1P56182 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP1P56182 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP1P56182 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP1P56182 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP1P56182 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP1P56182 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP1P56182 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP1P56182 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP1P56182 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP1P56182 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP1P56182 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP1P56182 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP1P56182 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP1P56182 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP1P56182 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP1P56182 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP1P56182 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP1P56182 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP1P56182 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP1P56182 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP1P56182 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP1P56182 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP1P56182 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP1P56182 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP1P56182 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP1P56182 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP1P56182 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP1P56182 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms