Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms