Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DAP3P51398 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DAP3P51398 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DAP3P51398 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DAP3P51398 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DAP3P51398 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DAP3P51398 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DAP3P51398 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DAP3P51398 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DAP3P51398 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DAP3P51398 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DAP3P51398 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DAP3P51398 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DAP3P51398 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DAP3P51398 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DAP3P51398 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DAP3P51398 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DAP3P51398 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DAP3P51398 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DAP3P51398 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DAP3P51398 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DAP3P51398 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DAP3P51398 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DAP3P51398 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DAP3P51398 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DAP3P51398 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DAP3P51398 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DAP3P51398 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DAP3P51398 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DAP3P51398 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DAP3P51398 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DAP3P51398 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DAP3P51398 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DAP3P51398 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DAP3P51398 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DAP3P51398 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DAP3P51398 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DAP3P51398 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DAP3P51398 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DAP3P51398 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DAP3P51398 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DAP3P51398 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DAP3P51398 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DAP3P51398 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DAP3P51398 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DAP3P51398 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DAP3P51398 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DAP3P51398 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DAP3P51398 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DAP3P51398 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DAP3P51398 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DAP3P51398 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DAP3P51398 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DAP3P51398 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DAP3P51398 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DAP3P51398 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DAP3P51398 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DAP3P51398 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DAP3P51398 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DAP3P51398 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DAP3P51398 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DAP3P51398 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DAP3P51398 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DAP3P51398 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DAP3P51398 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DAP3P51398 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DAP3P51398 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DAP3P51398 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DAP3P51398 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DAP3P51398 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DAP3P51398 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DAP3P51398 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DAP3P51398 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DAP3P51398 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DAP3P51398 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DAP3P51398 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DAP3P51398 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DAP3P51398 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DAP3P51398 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DAP3P51398 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DAP3P51398 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DAP3P51398 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DAP3P51398 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DAP3P51398 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DAP3P51398 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DAP3P51398 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DAP3P51398 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DAP3P51398 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DAP3P51398 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DAP3P51398 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DAP3P51398 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DAP3P51398 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DAP3P51398 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DAP3P51398 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DAP3P51398 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DAP3P51398 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DAP3P51398 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DAP3P51398 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DAP3P51398 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DAP3P51398 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms