Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB28P51157 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB28P51157 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB28P51157 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB28P51157 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB28P51157 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB28P51157 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB28P51157 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB28P51157 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB28P51157 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB28P51157 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB28P51157 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB28P51157 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB28P51157 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB28P51157 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB28P51157 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB28P51157 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB28P51157 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB28P51157 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB28P51157 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB28P51157 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB28P51157 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB28P51157 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB28P51157 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB28P51157 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB28P51157 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB28P51157 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB28P51157 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB28P51157 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB28P51157 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB28P51157 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB28P51157 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB28P51157 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB28P51157 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB28P51157 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB28P51157 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB28P51157 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB28P51157 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB28P51157 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB28P51157 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB28P51157 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB28P51157 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB28P51157 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB28P51157 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB28P51157 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB28P51157 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB28P51157 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB28P51157 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB28P51157 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB28P51157 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB28P51157 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB28P51157 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB28P51157 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB28P51157 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB28P51157 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB28P51157 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB28P51157 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB28P51157 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB28P51157 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB28P51157 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB28P51157 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB28P51157 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB28P51157 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB28P51157 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB28P51157 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB28P51157 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB28P51157 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB28P51157 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB28P51157 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB28P51157 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB28P51157 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB28P51157 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB28P51157 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB28P51157 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB28P51157 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB28P51157 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB28P51157 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB28P51157 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB28P51157 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB28P51157 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB28P51157 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB28P51157 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB28P51157 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB28P51157 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB28P51157 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB28P51157 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB28P51157 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB28P51157 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB28P51157 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB28P51157 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB28P51157 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB28P51157 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB28P51157 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB28P51157 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB28P51157 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB28P51157 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB28P51157 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB28P51157 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB28P51157 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB28P51157 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms