Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX5P50542 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX5P50542 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX5P50542 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX5P50542 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX5P50542 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX5P50542 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX5P50542 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX5P50542 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX5P50542 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX5P50542 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX5P50542 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX5P50542 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX5P50542 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX5P50542 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX5P50542 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX5P50542 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX5P50542 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX5P50542 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX5P50542 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX5P50542 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX5P50542 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX5P50542 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX5P50542 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX5P50542 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX5P50542 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX5P50542 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX5P50542 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX5P50542 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX5P50542 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX5P50542 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX5P50542 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX5P50542 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX5P50542 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX5P50542 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX5P50542 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX5P50542 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX5P50542 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX5P50542 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX5P50542 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX5P50542 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX5P50542 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX5P50542 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX5P50542 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX5P50542 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX5P50542 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX5P50542 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX5P50542 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX5P50542 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX5P50542 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX5P50542 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX5P50542 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX5P50542 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX5P50542 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX5P50542 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX5P50542 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX5P50542 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX5P50542 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX5P50542 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX5P50542 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX5P50542 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX5P50542 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX5P50542 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX5P50542 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX5P50542 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX5P50542 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX5P50542 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX5P50542 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX5P50542 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX5P50542 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX5P50542 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX5P50542 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX5P50542 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX5P50542 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX5P50542 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX5P50542 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX5P50542 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX5P50542 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX5P50542 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX5P50542 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX5P50542 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX5P50542 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX5P50542 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX5P50542 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX5P50542 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX5P50542 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX5P50542 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX5P50542 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX5P50542 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX5P50542 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX5P50542 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX5P50542 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX5P50542 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX5P50542 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX5P50542 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX5P50542 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX5P50542 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX5P50542 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX5P50542 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX5P50542 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms