Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRIM1P49642 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms