Protein–RNA interactions for Protein: P48201

ATP5G3, ATP synthase F(0) complex subunit C3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5G3P48201 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5G3P48201 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms