Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPL28P46779 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPL28P46779 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RPL28P46779 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPL28P46779 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPL28P46779 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPL28P46779 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPL28P46779 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPL28P46779 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPL28P46779 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPL28P46779 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPL28P46779 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPL28P46779 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPL28P46779 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPL28P46779 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RPL28P46779 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPL28P46779 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPL28P46779 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPL28P46779 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPL28P46779 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPL28P46779 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPL28P46779 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPL28P46779 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPL28P46779 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPL28P46779 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPL28P46779 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPL28P46779 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPL28P46779 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPL28P46779 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPL28P46779 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RPL28P46779 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPL28P46779 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPL28P46779 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPL28P46779 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPL28P46779 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPL28P46779 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPL28P46779 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPL28P46779 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPL28P46779 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPL28P46779 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPL28P46779 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPL28P46779 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPL28P46779 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPL28P46779 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPL28P46779 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPL28P46779 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPL28P46779 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPL28P46779 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPL28P46779 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPL28P46779 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPL28P46779 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPL28P46779 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPL28P46779 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPL28P46779 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPL28P46779 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPL28P46779 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RPL28P46779 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPL28P46779 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPL28P46779 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPL28P46779 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPL28P46779 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPL28P46779 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPL28P46779 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPL28P46779 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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RPL28P46779 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPL28P46779 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPL28P46779 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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RPL28P46779 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPL28P46779 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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RPL28P46779 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPL28P46779 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL28P46779 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL28P46779 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL28P46779 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL28P46779 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL28P46779 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL28P46779 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL28P46779 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL28P46779 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL28P46779 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL28P46779 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL28P46779 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL28P46779 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL28P46779 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL28P46779 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL28P46779 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL28P46779 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL28P46779 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL28P46779 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL28P46779 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL28P46779 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL28P46779 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL28P46779 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL28P46779 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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