Protein–RNA interactions for Protein: P41970

ELK3, ETS domain-containing protein Elk-3, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK3P41970 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ELK3P41970 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ELK3P41970 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ELK3P41970 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ELK3P41970 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ELK3P41970 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ELK3P41970 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELK3P41970 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELK3P41970 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELK3P41970 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELK3P41970 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELK3P41970 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELK3P41970 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELK3P41970 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELK3P41970 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELK3P41970 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELK3P41970 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ELK3P41970 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELK3P41970 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELK3P41970 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELK3P41970 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELK3P41970 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELK3P41970 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELK3P41970 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELK3P41970 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELK3P41970 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELK3P41970 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ELK3P41970 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELK3P41970 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELK3P41970 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELK3P41970 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELK3P41970 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELK3P41970 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELK3P41970 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELK3P41970 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELK3P41970 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELK3P41970 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELK3P41970 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELK3P41970 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELK3P41970 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELK3P41970 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELK3P41970 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELK3P41970 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELK3P41970 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELK3P41970 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELK3P41970 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELK3P41970 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELK3P41970 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELK3P41970 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELK3P41970 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELK3P41970 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELK3P41970 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELK3P41970 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELK3P41970 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELK3P41970 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELK3P41970 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELK3P41970 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELK3P41970 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELK3P41970 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELK3P41970 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELK3P41970 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELK3P41970 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELK3P41970 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELK3P41970 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELK3P41970 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELK3P41970 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELK3P41970 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELK3P41970 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELK3P41970 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELK3P41970 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELK3P41970 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELK3P41970 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELK3P41970 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELK3P41970 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ELK3P41970 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ELK3P41970 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ELK3P41970 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ELK3P41970 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ELK3P41970 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ELK3P41970 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ELK3P41970 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ELK3P41970 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ELK3P41970 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ELK3P41970 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ELK3P41970 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELK3P41970 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELK3P41970 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELK3P41970 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELK3P41970 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELK3P41970 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELK3P41970 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELK3P41970 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELK3P41970 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELK3P41970 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELK3P41970 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELK3P41970 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELK3P41970 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELK3P41970 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELK3P41970 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELK3P41970 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms