Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MDH1P40925 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MDH1P40925 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MDH1P40925 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MDH1P40925 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MDH1P40925 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MDH1P40925 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MDH1P40925 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MDH1P40925 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MDH1P40925 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MDH1P40925 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MDH1P40925 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MDH1P40925 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MDH1P40925 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MDH1P40925 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MDH1P40925 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MDH1P40925 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MDH1P40925 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MDH1P40925 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MDH1P40925 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MDH1P40925 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MDH1P40925 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MDH1P40925 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MDH1P40925 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MDH1P40925 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MDH1P40925 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MDH1P40925 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MDH1P40925 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MDH1P40925 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MDH1P40925 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MDH1P40925 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MDH1P40925 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MDH1P40925 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MDH1P40925 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MDH1P40925 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MDH1P40925 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MDH1P40925 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MDH1P40925 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MDH1P40925 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MDH1P40925 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MDH1P40925 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
MDH1P40925 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MDH1P40925 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MDH1P40925 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MDH1P40925 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MDH1P40925 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MDH1P40925 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MDH1P40925 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MDH1P40925 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MDH1P40925 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MDH1P40925 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MDH1P40925 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MDH1P40925 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MDH1P40925 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MDH1P40925 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MDH1P40925 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MDH1P40925 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MDH1P40925 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MDH1P40925 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MDH1P40925 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MDH1P40925 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MDH1P40925 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MDH1P40925 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MDH1P40925 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MDH1P40925 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MDH1P40925 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MDH1P40925 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MDH1P40925 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MDH1P40925 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MDH1P40925 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MDH1P40925 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MDH1P40925 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MDH1P40925 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MDH1P40925 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MDH1P40925 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MDH1P40925 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MDH1P40925 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MDH1P40925 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MDH1P40925 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MDH1P40925 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MDH1P40925 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MDH1P40925 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MDH1P40925 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MDH1P40925 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDH1P40925 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDH1P40925 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDH1P40925 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDH1P40925 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MDH1P40925 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDH1P40925 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDH1P40925 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDH1P40925 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MDH1P40925 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDH1P40925 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MDH1P40925 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDH1P40925 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDH1P40925 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MDH1P40925 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDH1P40925 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDH1P40925 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms