Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ETFBP38117 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ETFBP38117 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ETFBP38117 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ETFBP38117 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ETFBP38117 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ETFBP38117 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ETFBP38117 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ETFBP38117 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ETFBP38117 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ETFBP38117 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ETFBP38117 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ETFBP38117 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ETFBP38117 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ETFBP38117 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ETFBP38117 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ETFBP38117 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ETFBP38117 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ETFBP38117 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ETFBP38117 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ETFBP38117 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ETFBP38117 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ETFBP38117 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ETFBP38117 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ETFBP38117 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ETFBP38117 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ETFBP38117 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETFBP38117 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETFBP38117 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETFBP38117 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETFBP38117 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETFBP38117 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETFBP38117 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETFBP38117 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETFBP38117 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETFBP38117 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETFBP38117 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETFBP38117 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ETFBP38117 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETFBP38117 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETFBP38117 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETFBP38117 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETFBP38117 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETFBP38117 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETFBP38117 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETFBP38117 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ETFBP38117 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ETFBP38117 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ETFBP38117 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ETFBP38117 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ETFBP38117 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ETFBP38117 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ETFBP38117 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ETFBP38117 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ETFBP38117 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ETFBP38117 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ETFBP38117 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ETFBP38117 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
ETFBP38117 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ETFBP38117 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ETFBP38117 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ETFBP38117 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ETFBP38117 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ETFBP38117 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ETFBP38117 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ETFBP38117 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ETFBP38117 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ETFBP38117 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ETFBP38117 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ETFBP38117 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ETFBP38117 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ETFBP38117 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ETFBP38117 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ETFBP38117 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ETFBP38117 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ETFBP38117 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ETFBP38117 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ETFBP38117 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ETFBP38117 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ETFBP38117 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ETFBP38117 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ETFBP38117 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ETFBP38117 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ETFBP38117 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ETFBP38117 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ETFBP38117 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ETFBP38117 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ETFBP38117 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ETFBP38117 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ETFBP38117 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ETFBP38117 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ETFBP38117 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ETFBP38117 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ETFBP38117 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ETFBP38117 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ETFBP38117 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ETFBP38117 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ETFBP38117 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ETFBP38117 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ETFBP38117 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms