Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms